本综述深入探讨了AlphaFold2-Multimer（AF2-Multimer）、AlphaFold3（AF3）、Boltz-1及Chai-1等前沿模型在蛋白质-肽段复合物结构预测中的性能表现与内在机制。研究揭示了这些模型对训练集已见结构的显著偏好，并系统分析了多重序列比对（MSA）的质量、配对及进化信息在 ...